Re: distance between adjacent particles

Posted by jchanson on May 10, 2007; 6:48pm
URL: http://imagej.273.s1.nabble.com/distance-between-adjacent-particles-tp3699485p3699491.html

France -
        It looks like you initialize the value of "dist1" inside the for
loop where you're calculating all of the distances.  You should just
initialize it to a large value outside of the for loop.  Try this,
instead:

var dist1;
var dist;
                 for (i=0; i<nResults; i++) {
                                 XM=getResult("XM", i);
                                 YM=getResult("YM",i);
                                 a=nResults;
                                 a1 = newArray(a);
                                 for (b=0; b<nResults; b++){
                                                 XM2=getResult("XM", b);
                                                 YM2=getResult("YM",b);
dist=sqrt(((XM2-XM)*(XM2-XM))+((YM2-YM)*(YM2-YM)));
                                                 a1[b] = dist;
                                 }
                                 dist1=10000;
                                 for (b=0;b<a;b++){
                                                 dist=a1[b];
                                                 if(dist==0){dist=10000;}
                                                 if (dist>dist1)
{dist=dist1;}
                                                 dist1=dist;
                                 }
                                 print(dist1);
                                 setResult("shortest_dist", i, dist1);
                 }

                 updateResults();


Jeff
Senior Imaging Analyst
[hidden email]