Clear ROI

[Juanjo Vega]

Hi!

How can I reset the ROI from an image?

I want to remove whatever point or rectangle over the image.

I can't figure it out recording macros, I only can create new ROIs, but
there is no command to clear it.

Thanks!

Sincerelly,

Juanjo.

--
Juanjo Vega ([hidden email])

Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
Universidad Autónoma de Madrid.
28049, Madrid, Spain.

http://www.cnb.csic.es
http://www.biocomp.cnb.uam.es

[phone]


"Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan de él." - Discurso del Método, René Descartes.

[Juanjo Vega]

Maybe it's not a ROI but a selection, because it's not at the list until
I use the "Add" button.

I only place the points over the image nad then I get their values with:

       int xs[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getXCoordinates();
       int ys[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getYCoordinates();

That's because I think I should remove a ROI. But the selections doesn't
appear ROI Manager's list.

It's a bit weird...

Cathy Sorbara escribió:

> Hello,
>  
> Under Analyze --> Tools --> ROI Manager there is a "delete" option to
> remove ROIs from an image and it records all the ROIs you have made
> and you can rename them to keep them in order.
>  
> Hope that helps,
>  
> Cathy
>
> 2009/5/21 Juanjo Vega <[hidden email] <mailto:[hidden email]>>
>
>     Hi!
>
>     How can I reset the ROI from an image?
>
>     I want to remove whatever point or rectangle over the image.
>
>     I can't figure it out recording macros, I only can create new
>     ROIs, but there is no command to clear it.
>
>     Thanks!
>
>     Sincerelly,
>
>     Juanjo.
>
>     --
>     Juanjo Vega ([hidden email] <mailto:[hidden email]>)
>
>     Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
>     Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
>     C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
>     Universidad Autónoma de Madrid.
>     28049, Madrid, Spain.
>
>     http://www.cnb.csic.es <http://www.cnb.csic.es/>
>     http://www.biocomp.cnb.uam.es <http://www.biocomp.cnb.uam.es/>
>
>     [phone]
>
>
>     "Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las
>     mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino
>     recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan
>     de él." - Discurso del Método, René Descartes.
>
>

--
Juanjo Vega ([hidden email])

Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
Universidad Autónoma de Madrid.
28049, Madrid, Spain.

http://www.cnb.csic.es
http://www.biocomp.cnb.uam.es

[phone]


"Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan de él." - Discurso del Método, René Descartes.

[Juanjo Vega]

I found it!

From: http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=gui:edit:selection

run("Select None"); // Remove selected ROI

Juanjo Vega escribió:

> Maybe it's not a ROI but a selection, because it's not at the list
> until I use the "Add" button.
>
> I only place the points over the image nad then I get their values with:
>
>       int xs[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getXCoordinates();
>       int ys[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getYCoordinates();
>
> That's because I think I should remove a ROI. But the selections
> doesn't appear ROI Manager's list.
>
> It's a bit weird...
>
> Cathy Sorbara escribió:
>> Hello,
>>  
>> Under Analyze --> Tools --> ROI Manager there is a "delete" option to
>> remove ROIs from an image and it records all the ROIs you have made
>> and you can rename them to keep them in order.
>>  
>> Hope that helps,
>>  
>> Cathy
>>
>> 2009/5/21 Juanjo Vega <[hidden email] <mailto:[hidden email]>>
>>
>>     Hi!
>>
>>     How can I reset the ROI from an image?
>>
>>     I want to remove whatever point or rectangle over the image.
>>
>>     I can't figure it out recording macros, I only can create new
>>     ROIs, but there is no command to clear it.
>>
>>     Thanks!
>>
>>     Sincerelly,
>>
>>     Juanjo.
>>
>>     --     Juanjo Vega ([hidden email] <mailto:[hidden email]>)
>>
>>     Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
>>     Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
>>     C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
>>     Universidad Autónoma de Madrid.
>>     28049, Madrid, Spain.
>>
>>     http://www.cnb.csic.es <http://www.cnb.csic.es/>
>>     http://www.biocomp.cnb.uam.es <http://www.biocomp.cnb.uam.es/>
>>
>>     [phone]
>>
>>
>>     "Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las
>>     mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino
>>     recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan
>>     de él." - Discurso del Método, René Descartes.
>>
>>
>

--
Juanjo Vega ([hidden email])

Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
Universidad Autónoma de Madrid.
28049, Madrid, Spain.

http://www.cnb.csic.es
http://www.biocomp.cnb.uam.es

[phone]


"Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan de él." - Discurso del Método, René Descartes.

[Cathy Sorbara]

I see  ... great :)

On Thu, May 21, 2009 at 3:52 PM, Juanjo Vega <[hidden email]> wrote:

> I found it!
>
> From: http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=gui:edit:selection
>
> run("Select None"); // Remove selected ROI
>
> Juanjo Vega escribió:
>
>> Maybe it's not a ROI but a selection, because it's not at the list until I
>> use the "Add" button.
>>
>> I only place the points over the image nad then I get their values with:
>>
>>      int xs[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getXCoordinates();
>>      int ys[] = ((PointRoi) IJ.getImage().getRoi()).getYCoordinates();
>>
>> That's because I think I should remove a ROI. But the selections doesn't
>> appear ROI Manager's list.
>>
>> It's a bit weird...
>>
>> Cathy Sorbara escribió:
>>
>>> Hello,
>>>  Under Analyze --> Tools --> ROI Manager there is a "delete" option to
>>> remove ROIs from an image and it records all the ROIs you have made and you
>>> can rename them to keep them in order.
>>>  Hope that helps,
>>>  Cathy
>>>
>>> 2009/5/21 Juanjo Vega <[hidden email] <mailto:[hidden email]>>
>>>
>>>    Hi!
>>>
>>>    How can I reset the ROI from an image?
>>>
>>>    I want to remove whatever point or rectangle over the image.
>>>
>>>    I can't figure it out recording macros, I only can create new
>>>    ROIs, but there is no command to clear it.
>>>
>>>    Thanks!
>>>
>>>    Sincerelly,
>>>
>>>    Juanjo.
>>>
>>>    --     Juanjo Vega ([hidden email] <mailto:[hidden email]>)
>>>
>>>    Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
>>>    Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
>>>    C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
>>>    Universidad Autónoma de Madrid.
>>>    28049, Madrid, Spain.
>>>
>>>    http://www.cnb.csic.es <http://www.cnb.csic.es/>
>>>    http://www.biocomp.cnb.uam.es <http://www.biocomp.cnb.uam.es/>
>>>
>>>    [phone]
>>>
>>>
>>>    "Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las
>>>    mayores virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino
>>>    recto pueden llegar más lejos que los que corren pero se apartan
>>>    de él." - Discurso del Método, René Descartes.
>>>
>>>
>>>
>>
> --
> Juanjo Vega ([hidden email])
>
> Unidad de Biocomputación. Laboratorio B-13.
> Centro Nacional de Biotecnología. CNB-CSIC.
> C\ Darwin, 3. Campus de Cantoblanco.
> Universidad Autónoma de Madrid.
> 28049, Madrid, Spain.
>
> http://www.cnb.csic.es
> http://www.biocomp.cnb.uam.es
>
> [phone]
>
>
> "Las mejores almas son capaces de los mayores vicios como de las mayores
> virtudes, y aquellos que caminan despacio por el camino recto pueden llegar
> más lejos que los que corren pero se apartan de él." - Discurso del Método,
> René Descartes.
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